（1）进入洁净室（区）的人员和物料应有各自的净化用室和设施，其设置要求应与洁净室（区）的洁净等级相适应。
（2）根据生产规模的大小，洁净区内应分别设置原辅料暂存区、半成品区、待验区、合格区和不合格区，以最大限度地减少差错和交叉污染。
（3）在满足生产工艺要求的前提下，要合理布置人员和物料的进出通道，其出口应分别独立设置，并避免交叉、往返。
（4）应尽量减少洁净车间的人员和物料的出人口，以利于全车间的洁净度的控制。
（5）洁净等级不同的洁净室之间的人员和物料进出，应设置防止交叉污染的设施。
（6）若物料或产品会产生气体、蒸气或喷雾物，则应设置防止交叉污染的设施。
（7）进入洁净厂房的空气、压缩空气和惰性气体等均应按照工艺要求进行净化。
（8）电梯不宜设在洁净区内。如确实需要时，电梯前及机房应设置确保洁净区空气洁净度级别的设施，人员和物料使用的电梯宜分开。（9）不同药品、不同规格的生产操作不能布置在同一生产操作内。当有多条包装线同时进行包装时，相互之间应分隔开来或设置有效的防止混淆及交叉污染的设施。
（10）更衣室、浴室和厕所的设置，不得对洁净区产生不良影响。
（11）要合理布置洁净区内水池和地漏的安装位置，以免对药品产生污染。
